国家植物园（China National Botanical Garden），始建于1956年，2022年正式揭牌。位于北京市海淀区，总规划面积近600公顷，分南园、北园两个园区，现开放面积约300公顷，收集各类植物1.75万种，其中珍稀濒危植物近千种。

华南国家植物园，位于广东省广州市天河区，占地面积333公顷，由国家林草局、住房城乡建设部、中科院、广东省和广州市合作共建，是中国设立的第二个国家植物园，是中国历史最久、种类最多、面积最大的南亚热带植物园，有“中国南方绿宝石”之称。华南国家植物园依托中国科学院华南植物园设立。华南国家植物园有两个园区。广州园区包括植物迁地保护及对外开放园区和科学研究园区。肇庆鼎湖山园区即广东鼎湖山国家级自然保护区暨树木园。

中国科学院西双版纳热带植物园是集科学研究、物种保存与科普教育为一体的综合性研究机构和国内外知名的风景名胜区，秉承“秉恒致知 和实生物”的核心理念，以建设“生态学与生物多样性研究基地和热带植物大本营”为定位，促进我国生物多样性保护和可持续发展。1959年创建。全园占地面积约1,125公顷，收集活植物13,000多种，建有39个植物专类区，保存有一片面积约250公顷的原始热带雨林，是我国面积最大、收集物种最丰富、专类园区最多的植物园，也是世界上户外保存植物种数和向公众展示的植物类群数最多的植物园。

中国科学院武汉植物园筹建于1956年，1958年正式成立，是集科学研究、物种保育和科普开放为一体的综合性科研机构，是我国三大核心科学植物园之一，包含光谷、磨山、中-非联合研究中心-肯尼亚园区，江夏、新洲两个基地及多个野外观测台站。磨山园区坐落于东湖之滨、磨山南麓，面积为886亩，为国家植物资源储备和植物迁地保护的综合研究基地，现收集保育植物资源13000余种，建有世界上涵盖遗传资源最广的猕猴桃专类园等17个特色专类园。

昆明植物园，立足云贵高原、横断山及邻近地区，面向青藏高原和喜马拉雅，突出极小种群植物拯救保护特色，全覆盖收集保存国家重点保护和珍稀濒危野生植物种质资源，集科学研究、物种保存、科普与公众认知为一体，为国家生态文明和美丽中国建设服务。 全园含两个园区，分别是位于滇中高原的昆明园区和位于滇西北高原的丽江园区。昆明园区始建于1938年，位于昆明北郊黑龙潭风景区，占地面积5091亩，海拔约1990米。

上海辰山植物园位于上海松江区佘山国家旅游度假区内，是集科研、科普和观赏游览于一体的综合性植物园，由上海市人民政府、中国科学院和国家林草局（原国家林业局）合作共建，占地207公顷，于2010年4月初步建成并对外开放。 辰山的定位以 “国内领先、国际一流”为目标，以“精研植物、爱传大众”为使命，立足华东，面向东亚，进行植物的收集、研究、开发和利用。

南京中山植物园（江苏省中国科学院植物研究所）前身为建于1929年的中央研究院自然历史博物馆和建于1929年的“总理陵园纪念植物园”（中国第一座国立植物园）。1954年，中国科学院植物分类研究所华东工作站接管和重建了南京中山植物园，定名为中国科学院南京中山植物园。1960年发展成立中国科学院南京植物研究所，开始了植物园与植物研究所“园、所一体”的体制。1970年划归江苏省领导，定名为江苏省植物研究所（南京中山植物园）。1993年起，实行江苏省与中国科学院的双重领导，定名江苏省中国科学院植物研究所（南京中山植物园）。 　　所（园）占地186公顷，坐落于南京钟山风景区内，面山临湖，傍依古城墙。园中气候温和，植被茂盛，融山、水、城、林于一体，秀色天成，风光旖旎，既是一个奥妙无穷的植物王国，又是一个独具魅力的旅游胜地。九十多年来，经过几代人的不懈努力，所（园）已成为一座享誉中外，集科研、科普和游览于一体的综合性现代化的植物所（园）。